孔融是孔子的后人。《世说新语·言语》中，元礼问曰：“君与仆有何亲？”对曰：“昔先君仲尼与君先人伯阳有师资之尊，是仆与君奕世为通好也。”由此可见孔融是孔子的后人。

孔融少有异才，勤奋好学，与平原人陶丘洪、陈留人边让齐名。汉献帝时期，他历任北军中侯、虎贲中郎将、北海国相等职。孔融在北海六年，修城邑，立学校，举贤才，颇有治绩。建安元年被朝廷征为将作大匠，迁少府，又任太中大夫。