《使徒行者3》阿梅死了。郑淑梅是卧底警员，天真活泼的新扎卧底，在卓凯不断传授卧底及跟踪技巧后成为卓凯的下属兼徒弟，被他委派进入长兴内部调查，成为长兴地下钱庄的管账。同时，她与乐少锋、徐天堂有微妙的三角关系。

薛家强完成三年卧底任务後，回港开设沐足店，继续收集情报。刑事情报科总督察章纪孜怀疑卓凯出狱後投入黑道，对他进行全面监视。家强与卓凯卷入器官贩卖案，联同女卧底窦亚希及保安局调查官韦作荣，合力捣破涉案集团。保安局及後新设安全情报机构，并邀得徐天堂加入，接管刑事情报科的工作。覃欢喜逃过一死後，暗中调查某社团的秘密。神秘社团原来由长兴已故龙头魏德信的弟弟魏德礼创立，他还设下布局，对家强、卓凯等展开报复。